Цитата: Да, с НДС
В таком случае можете принимать НДС с лизинга к вычету, если получен верно оформленный с/ф, остальные условия (налог предъявлен, используется в деятельности, облагаемой НДС) ст. 171 НК, 172 НК выполняются.
Цитата: За год по договору лизинга НДС выплачено около 1 000 000 руб., а налог начисленный к уплате намного меньше.
Если получается к возмещению, то возмещайте (ст. 176 НК)
Напомню:
Цитата: 1.1. Налоговые вычеты, предусмотренные пунктом 2 статьи 171 настоящего Кодекса, могут быть заявлены в налоговых периодахв пределах трех летпосле принятия на учет приобретенных налогоплательщиком на территории Российской Федерации товаров (работ, услуг), имущественных прав или товаров, ввезенных им на территорию Российской Федерации и иные территории, находящиеся под ее юрисдикцией.
Если хотите избежать камеральной проверки с истребованием документов, можете перенести вычет НДС на будущие периоды, что бы по декларации не получалось к возмещению.